Oddział Chirurgii rozpoczął działalność 22 września 1998 r. Ordynatorami Oddziału byli: dr n. med. Zbigniew Waga (1998 – 2004) i dr n. med. Krzysztof Korneta (2004 – 2012). Do 2012 r. funkcję zastępców Ordynatora pełnili: lek. med. Jerzy Mazur oraz lek. med. Jan Adamczyk. Od 2012 r. funkcję Ordynatora pełni lek. med. Jan Adamczyk, a stanowisko zastępcy Ordynatora – dr Tomasz Romanowicz. Od początku działalności Oddziału obowiązki Pielęgniarki Oddziałowej pełni mgr piel. Teresa Dziuba.

Oddział został utworzony na bazie Oddziału Chirurgii Ogólnej Wojewódzkiego Szpitala Zespolonego w Zamościu, z którego przeniesiony został cały personel medyczny. Początkowo oddział działał pod nazwą Oddział Chirurgii Ogólnej, następnie w pierwszym roku działalności został przemianowany na Oddział Chirurgii z Neurotraumatologią, Chirurgią Naczyniową i Ośrodkiem Urazów Wielonarządowych. Na oddziale pracowali specjaliści chirurgii ogólnej oraz lekarze innych specjalności chirurgicznych, tj. neurochirurgii (dr Adam Harasimiuk) oraz chirurgii naczyniowej (dr Marek Durakiewicz). Pododdziały Chirurgii Naczyniowej oraz Neurochirurgii działały w ramach oddziału chirurgicznego do 2006 r. W tym samym roku, po utworzeniu samodzielnych oddziałów Chirurgii Naczyniowej i Neurochirurgii, oddział powrócił do starej nazwy Oddziału Chirurgii Ogólnej, pod którą działał do 2009 r., kiedy utworzono Oddział Chirurgii Ogólnej i Onkologicznej.

W okresie działalności oddziału zmienił się jego zakres. Na początku działalność medyczna koncentrowała się głównie na chirurgii gastroenterologicznej oraz urazach wielonarządowych. Znaczącą rolę odegrał Zakład Endoskopii kierowany przez lek. med. Roberta Zymona, działający w ramach oddziału chirurgicznego. W zakładzie rozwinięto nowoczesne procedury endoskopowe stosowane w chirurgii gastroenterologicznej oraz onkologicznej. Następnie zakres zabiegów poszerzył się wraz z zatrudnieniem specjalistów z zakresu chirurgii naczyniowej oraz neurochirurgii. Utworzenie samodzielnych oddziałów Chirurgii Naczyniowej i Neurochirurgii oraz zdobywanie dodatkowych specjalizacji przez lekarzy spowodowało zmianę profilu oddziału w kierunku onkologicznym.

Obecna aktywność oddziału obejmuje chirurgię onkologiczną, gastroenterologiczną (w tym zabiegi laparoskopowe i endoskopowe) oraz endokrynologiczną (głównie tarczyce i przytarczyce) z niewielkim udziałem urazów wielonarządowych. W ramach oddziału działa pracownia ultrasonograficzna, w której oprócz badań chirurgicznych wykonywane są zabiegi mało inwazyjne. Funkcjonują także Poradnia Chirurgiczna i Poradnia Proktologiczna.

W 2008 r. rozpoczęto na szeroką skalę wykonywanie mastektomii w raku piersi, a następnie zabiegów oszczędzających pierś. Od pozyskania ręcznego detektora promieniowania gamma w 2011 r. wdrożono procedurę węzła wartowniczego w raku piersi oraz czerniaka. W 2012 r. zakupiono urządzenie do termoablacji falami o częstotliwości radiowej, co poszerzyło zakres operacji onkologicznych. Na 40 łóżkach oddział realizuje świadczenia z zakresu chirurgii ogólnej oraz onkologicznej, będąc jedynym oddziałem chirurgii onkologicznej na terenie Lubelszczyzny poza ośrodkami w Lublinie.

Od początku działalności oddziału tytuł specjalisty z zakresu chirurgii ogólnej uzyskało 8 lekarzy, a tytuł specjalisty z zakresu chirurgii onkologicznej – 3 lekarzy. W 2007 r. dr Tomasz Romanowicz obronił pracę doktorską.

W skład personelu lekarskiego wchodzą: Tomasz Romanowicz, Krzysztof Siejczuk, Beata Gwoździak, Zbigniew Żołyński, Jerzy Pukaluk, Marek Mazurek, Lech Brogowski, Andrzej Traczyk, Anna Marzec i Marek Siemczyk.

Na oddziale zatrudnionych jest 29 pielęgniarek oraz 2 pielęgniarki w Poradni Chirurgicznej. Wśród pielęgniarek 5 posiada tytuł magistra pielęgniarstwa, 12 – tytuł specjalisty w dziedzinie pielęgniarstwa chirurgicznego, a 14 – licencjat pielęgniarstwa. Obsługę oddziału stanowi 7 osób, w tym 2 sekretarki medyczne, 4 salowe oraz referent.